Viện Tài nguyên và Môi trường (trước đây là Trung tâm Nghiên cứu Tài nguyên và Môi trường) là đơn vị có bề dày kinh nghiệm trong đào tạo sau đại học trong lĩnh vực quản lý tài nguyên thiên nhiên và phát triển bền vững. Từ những năm 1990 Trung tâm Nghiên cứu Tài nguyên và Môi trường đã liên tục tổ chức nhiều khóa đào tạo sau đại học với thời lượng 3 tháng về “Quản lý bền vững tài nguyên miền núi”, 6 tháng về “Tiếp cận sinh thái học trong quản lý tài nguyên thiên nhiên và phát triển bền vững”, và 10 tháng về “Quản lý và đánh giá tác động môi trường” với các học viên đến từ tất cả các tỉnh, thành trong cả nước.
Năm 2004, Trung tâm Nghiên cứu Tài nguyên và Môi trường đã được Đại học Quốc gia Hà Nội giao tổ chức thực hiện Chương trình đào tạo thạc sĩ, tiến sĩ chuyên ngành “Môi trường trong phát triển bền vững” và sau này chuyển thành “Môi trường và phát triển bền vững”. Đến nay, Viện Tài nguyên và Môi trường đã đào tạo được 189 thạc sĩ và 20 tiến sĩ. Hiện nay 03 nghiên cứu sinh đang học tập tại đơn vị.
Sau 4 năm tạm dừng tuyển sinh do công tác tổ chức của đơn vị, năm 2018 Viện Tài nguyên và Môi trường tiếp tục được Đại học Quốc gia Hà Nội giao tổ chức đào tạo tiến sĩ chuyên ngành mang tính liên ngành “Môi trường và phát triển bền vững” với khung chương trình được bổ sung, cập nhật và điều chỉnh phù hợp với thực tiễn và đáp ứng nhu cầu cấp thiết của xã hội và đồng thời tiếp cận cơ hội phát triển do cách mạng công nghiệp 4.0 và xu thế hội nhập toàn cầu mang lại.